استانبول ازهمه طرف با آبهای مختلف از جمله تنگه بسفر, دریای مرمره و دریای سیاه احاطه شده است؛در نتیجه حمل ونقل دریایی در آن بسیار حیاتی است.برای رفت و آمد بین دو بخش اروپایی و آسیایی
شهر,از کشتی ها و قایق های مسافربری استفاده می شود . قایق های مسافربری و اتوبوس دریایی ( Seabus ) پرسرعت , اصلی ترین راه های ارتباط بین استانبول و جزایر پرنس ( Prince )را تشکیل می
دهند.
بندر استانبول , مهم ترین بندر ترکیه است. بندرگاه گلدن هورن , اصولأ برای کشتی های کوچک و یا قایق های شخصی استفاده می شود؛در حالی که بندر کاراکوی ( Karakoy ) در گالاتا ,عبور و مرور کشتی
های بزرگ انجام می شود.اصلی ترین قسمت بارگیری در منطقه حارم ( Harem ) در بخش آسیایی شهر قرار دارد.
ایدو( IDO ) متصدی اتوبوس های دریایی پرسرعت در سال 1987 تأسیس شد.این اتوبوس های دریایی بین بخش اروپایی و آسیایی استانبول حرکت می کنند.لنج هایی که بین ینیکاپی ( Yenikapi ) , در
بخش اروپایی استانبول و باندیرما ( Bandirma ) تردد میکنند , باعث کاهش فاصله بین استانبول و ازمیر و دیگر نقاط اصلی در ساحل اژه می شوند.لنج هایی که بین ینیکاپی یا پندیک ( Pendik ) در بخش
آسیایی استانبول و یالوا ( Yalova ) تردد می کنند,فاصله بین استانبول , بورسا یا آنتالیا را به طرز قابل توجهی کاهش می دهند.
